» » Создан самый большой набор геномов млекопитающих

Создан самый большой набор геномов млекопитающих

Создан самый большой набор геномов млекопитающих
Большой международный консорциум, возглавляемый учеными из Упсальского университета и Института Броуда Массачусетского технологического института и Гарварда, секвенировал геном 130 млекопитающих и проанализировал данные вместе со 110 существующими геномами, чтобы позволить ученым определить важные позиции в ДНК. Эта новая информация может помочь как в исследовании мутаций болезней у людей, так и в том, как лучше всего сохранить исчезающие виды. © Susanna Hamilton

Международная группа исследователей под названием Zoonomia Project проанализировала и сравнила полные геномы более 80 процентов всех семейств млекопитающих, охватывающих почти 110 миллионов лет эволюции. Набор геномных данных, опубликованный в журнале Nature, включает геномы более чем 120 видов, которые ранее не были секвенированы, и отражает разнообразие млекопитающих в беспрецедентном масштабе.

Набор данных направлен на продвижение исследований в области здоровья человека. Исследователи могут использовать эти данные для сравнения геномов людей и других млекопитающих, что может помочь идентифицировать области генома, которые могут быть вовлечены в заболевания человека.

Авторы также делают набор данных доступным для научного сообщества через веб-сайт Zoonomia Project без каких-либо ограничений на использование.

«Основная идея проекта заключалась в разработке и использовании этих данных, чтобы помочь генетикам определить, какие мутации вызывают болезнь», – сказала соавтор исследования Керстин Линдблад-Тох, научный руководитель отдела геномики позвоночных и профессор сравнительной геномики в Uppsala University.

Анализируя новые геномы, авторы также обнаружили, что виды млекопитающих с высокими показателями вымирания имеют меньшее генетическое разнообразие. Полученные данные свидетельствуют о том, что секвенирование даже одного человека может дать важную информацию экономичным способом, о том, какие популяции могут подвергаться более высокому риску исчезновения, и что им следует уделять приоритетное внимание для углубленной оценки потребностей в сохранении.

«Мы написали статью, чтобы рассказать об этом большом уникальном наборе данных и объяснить, почему он интересен. Как только вы сделаете данные широко доступными и объясните их полезность более широкому исследовательскому сообществу, вы действительно сможете изменить способ ведения науки», – говорят ученые.

Данные о зоономии уже помогли ученым в недавнем исследовании оценить риск заражения SARS-CoV-2 у многих видов. Исследователи идентифицировали 47 млекопитающих, которые с высокой вероятностью являются резервуарами или промежуточными хозяевами вируса SARS-CoV-2.

Картирование млекопитающих

Проект «Зоономия», ранее называвшийся «Проектом 200 млекопитающих», основан на предыдущем проекте «29 млекопитающих», который начал секвенирование геномов млекопитающих в 2006 году. Последний проект расширяет эту работу, исследуя геномы видов от белок до долгоживущих летучих мышей. В проект также были включены геномы исчезающих видов.

В новом исследовании ученые сотрудничали с 28 различными учреждениями по всему миру, чтобы собрать образцы для геномного анализа, причем почти половину образцов предоставил Frozen Zoo в зоопарке Сан-Диего. Команда сосредоточилась на видах, представляющих медицинский, биологический интерес и сохранении биоразнообразия, и увеличила процент семей млекопитающих с репрезентативным геномом с 49 до 82.

В рамках проекта также были разработаны и используются инструменты, которые позволят исследователям изучить каждую «букву» или основание в последовательности генома млекопитающих и сравнить ее с последовательностями в эквивалентных местах в геноме человека, включая области, которые могут быть вовлечены в заболевание. Это могло бы помочь исследователям идентифицировать генетические участки, которые оставались неизменными и функционировали в течение эволюционного времени, и те, которые мутировали случайным образом. Если ген оставался стабильным у млекопитающих на протяжении миллионов лет, он, вероятно, выполняет важную функцию, поэтому любое изменение в нем потенциально может быть связано с болезнью.

Публикуя данные, авторы призывают научное сообщество поддержать полевых исследователей в сборе образцов, расширить доступ к вычислительным ресурсам, которые позволяют анализировать огромные наборы геномных данных, и быстро и открыто обмениваться геномными данными.

«Одна из самых захватывающих вещей в проекте «Зоономия» заключается в том, что многие из наших основных вопросов доступны людям как в рамках науки, так и за ее пределами, – сказала первый автор статьи Дайан Женере. «Разрабатывая научные проекты, доступные для всех, мы можем обеспечить пользу для здоровья населения, человека и окружающей среды».

A comparative genomics multitool for scientific discovery and conservation, Nature (2020). DOI: 10.1038/s41586-020-2876-6 , www.nature.com/articles/s41586-020-2876-6

12 ноябрь 2020 /
  • Не нравится
  • 0
  • Нравится

Похожие новости

Палеонтологи обнаружили ранее неизвестный вид цинодонтов – Kataigidodon venetus

Недавно идентифицированный вид цинодонтов, получивший научное название Kataigidodon venetus, жил около 220 миллионов лет назад.

Ученые сообщили о новом успехе в расшифровке полного генома человека

Международный консорциум ENCODE, состоящий из 500 ученых-биологов из многих стран мира сообщил о завершении третьего этапа глобального проекта по составлению энциклопедии функциональных элементов ДНК.

Речь, вероятно, возникла из-за желания млекопитающих звучать брутально

Европейские зоологи проверили, обладают ли животные, занижающие голосовые сигналы, чтобы казаться крупнее, способностью к обучению новым звукам.

Формирование коры головного мозга отодвинули на 300 миллионов лет

В этом открытии ученым помогли "живые ископаемые" – примитивные бесчелюстные рыбы миноги и миксины

Могут ли панголины быть промежуточными хозяевами коронавируса?

Ученые всего мира ищут животное, от которого коронавирус 2019-nCoV передался человеку. Так как геном 2019-nCoV почти на 80% схож с геномом тяжелого острого респираторного синдрома (SARS), в поисках

Ученые выяснили, когда и почему животные начали издавать звуки

Построив эволюционное дерево, охватывающее последние 350 миллионов лет, ученые выяснили, что первые позвоночные не имели голоса.
Комментарии

НАПИСАТЬ КОММЕНТАРИЙ

Ваше Имя:
Ваш E-Mail:
Код:
Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:
Популярные новости
Ответ на вопрос – зачем в древности был нужен и как использовался «Римский додекаэдр».Америка-2020 как АтлантидаВ группе Дятлова их было 12 по АПВЕРГИДуАмериканская компания Pfizer объявила о создании рабочей вакцины от коронавирусаПирамида Хеопса состоит из трёх пирамидФизики говорят, что Вселенная наполнена загадочной субстанцией, называемой «квинтэссенцией»Настоящий Монте-КристоХаббл заметил тень от сверхмассивной черной дыры в галактике IC 5063