» » Открытое древо жизни

Открытое древо жизни


Открытое древо жизни

Открытое древо жизни

Над выяснением эволюционной истории живого мира ученые бьются веками. На сегодняшний день задокументировано более 2 млн видов живых организмов (растений, животных, бактерий, грибов, вирусов и т. д.) а еще большее количество их только предстоит описать. Используя морфологические и молекулярные методы, исследователи сконструировали и опубликовали уже десятки тысяч филогенетических деревьев и работ, описывающих эволюционную историю животных, растений и микроорганизмов. В таком огромном массиве данных несложно и потеряться.

На рисунке — первый набросок глобального дерева жизни, охватывающего более 2,3 млн видов живых организмов. Исследователи из 11 научных учреждений решили объединиться и собрать все воедино, чтобы любой человек за несколько кликов мышки мог посмотреть, что же удалось в итоге выяснить ученым. Так родился проект The Open Tree of Life — открытое «супердерево» жизни, которое объединило более 6 800 филогенетических деревьев, опубликованных ранее. Большинство из них, к сожалению, не удалось использовать для моделирования из-за отсутствия оцифрованных данных. Например, информация о бактериях (красный сектор) хорошо представлена в открытых базах данных, чем не может похвастаться большинство более крупных организмов.


Открытое древо жизни

Открытое древо жизни

Изображенное дерево содержит линии, включающие как минимум 500 потомков. Aразными цветами показаны доли родословных, представленных в базе национального центра биотехнологической информации (NCBI). Bцветом показано биоразнообразие, оцененное по количеству конечных веточек-потомков. C — темным показаны ветки, имеющие хотя бы одного представителя в исходном дереве


Конечно, при создании такого большого дерева не обошлось и без спорных моментов, ведь и в современной систематике существуют конкурирующие между собой гипотезы, дающие разное объяснение одним и тем же вещам. Например, монофилия архей спорна: некоторые ученые объединяют с ними эукариот, а не выделяют тех в отдельную кладу.


Открытое древо жизни

Открытое древо жизни

Несмотря на то, что The Open Tree of Life содержит только одно решение для любого узла, исходная база данных содержит конфликты между разными деревьями и таксономиями. На рисунке — два примера таких конфликтов: между разными базами данных по эукариотам (Eukaryota) и многоклеточным животным (Metazoa). Линиями разных цветов показаны конкурирующие деревья


Таким образом, новое мегадерево жизни еще далеко от завершения. Как говорит эволюционный биолог Карен Кранстон из Университета Дьюка в США, первый набросок дерева «не обобщает все, что мы знаем, однако вебсайт сконструирован так, чтобы сообщество с легкостью могло налаживать супердерево при помощи комментариев и добавления новых данных». Таким образом, проект получился динамичным и доступным каждому для чтения и редактирования — своего рода эволюционная Википедия жизни.

Рисунки из статьи C. Hinchliff et al., 2015. Synthesis of phylogeny and taxonomy into a comprehensive tree of life.

Вероника Самоцкая

04 ноябрь 2019 /
  • Не нравится
  • 0
  • Нравится

Похожие новости

Платизои ставят под сомнение происхождение двусторонне-симметричных животных от целомического предка

Новое генетическое исследование позволило уточнить характер родства между группами Lophotrochozoa (к которой относятся, например, кольчатые черви и моллюски) и Platyzoa (к которой относятся,

Мир меняется и подземная биота меняется вместе с ним

В журнале Nature представлен обзор имеющихся на сегодняшний день данных по биоразнообразию почв. Неожиданно эта, казалось бы, тривиальная тематика предстает совершенно иначе. С позиций современных

Биоразнообразие полезно для здоровья

Ученые с факультета интегративной биологии Южно-Флоридского университета в Тампе (США) обобщили все научные работы, в которых исследовалась зависимость заражения паразитами от факторов среды. Анализ

Запах плодов эволюционирует вместе с предпочтениями распространителей семян

Многие особенности формы и окраски цветов и плодов объясняются коэволюцией с животными — опылителями и распространителями семян. А является ли аромат спелых плодов специальной адаптацией для

Анализ черепов сотен видов чешуйчатых показал, что предок змей жил под землей

Вопрос происхождения змей и образа жизни, который вел их предок, до сих пор остается одной из нерешенных эволюционных загадок. Традиционно предлагаются три гипотезы: подземная, морская и наземная.

Вселенные с двумя измерениями могут быть обитаемыми

Ученые Калифорнийского университета и Массачусетского технологического института пришли к выводу, что законы физики во Вселенной с двумя пространственными и одним временным измерениями допускают
Комментарии

НАПИСАТЬ КОММЕНТАРИЙ

Ваше Имя:
Ваш E-Mail:
Код:
Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:
Популярные новости
Шугаринг: плюсы и минусыПреимущества матрасов MatroluxeОсобенности продвижения сайтаПульмонология, лечение в АвстрииКак рождаются самые мощные магниты во ВселеннойУпавший в Коста-Рике метеорит пахнет брюссельской капустойКак заменить реальный срок на ИТРРедчайший метеор: дневные Секстантиды